二手气质联用仪被广泛应用于复杂组分的分离与鉴定，其具有GC的高分辨率和质谱的高灵敏度，是生物样品中药物与代谢物定性定量的有效工具。它是在离子源部分将样品分子电离，形成离子和碎片离子，再通过质量分析器按照质荷比的不同进行分离，最后在检测器部分产生信号，并放大、记录得到质谱图。
一、开机操作
打开载气（He气），设置分压阀压力至0.5MPa。
2、打开计算机，进入WindowsXP系统。
3、打开气相色谱7890NGC、质谱5975NMSD电源，等待仪器自检完毕。
4、在计算机桌面双击工作站图标“Instrument#1”，进入MSD化学工作站。
5、仪器稳定1～2小时。
6、观察真空泵状态；观察离子源、四极杆温度的实际值是否达到设定值。
7、设定条件，测定样品。
二、关机操作
1、在仪器控制菜单中，单击“视图”菜单，选择“真空控制”，进入诊断与真空控制界面。
2、在真空菜单中选择“放空”，工作站将柱温设为30℃，关闭辅助加热。该过程大约需要40分钟。
3、等待放空结束，退出工作站，关闭计算机。
4、分别关闭气相、质谱电源。
5、关闭载气He。
气质联用仪是一个气体运行的系统，因而仪器的密封性相当重要。毛细管柱进入质谱腔中的长度不适当，太长或太短都不行。垫圈要松紧合适，太松会有漏气的隐患，太紧则会压碎垫圈，每次更换色谱柱时需要更换新的密封垫圈。清洗离子源时打开腔体后要注意其密封性。
